- Merkx, Femke (2016), Kiezen voor intervisie. Een nieuwe methode van kwaliteitszorg voor praktijkgericht onderzoek, in: TH&MA Hoger Onderwijs(5), p.43-48.
- Merkx, Femke (2016),Intervisie praktijkgericht onderzoek Handreiking voor de projectleider en medewerker onderzoekskwaliteit, Nationaal Regieorgaan Praktijkgericht Onderzoek.
- Merkx, Femke (2016), Intervisie praktijkgericht onderzoek Handreiking voor de gespreksleider, Nationaal Regieorgaan Praktijkgericht Onderzoek.
- Merkx, Femke (2015), Co-creatie in de zorg: koken zonder recept. Drie aanwijzingen om co-creatie tot een succes te maken, in: Kwaliteit in zorg, Tijdschrift over kwaliteit en veiligheid in zorg, nr. 2, p. 8-11.
- Dries Hegger, Ymkje de Boer, Astrid Offermans, Femke Merkx, Carel Dieperink, René Kemp, Harro van Lente en Ron Cörvers (2013). Kenniscocreatie naar productieve samenwerking tussen wetenschappers en beleidsmakers.
- Merkx, Femke (2013) ‘Kenniscoproductie, hoe doe je dat?’ in: Kenniscoproductie voor de grote maatschappelijke vraagstukken red. Wouter Boon en Edwin Horlings, Rathenau Instituut, Den Haag, SciSA rapport 1329.
- Merkx, Femke (2012) Samenwerken aan werkzame kennis. Methoden en technieken voor kenniscocreatie, Den Haag, Rathenau Instituut. SciSA rapport 1223.
- Merkx, Femke (2008) Organizing responsibilities for novelties in medical genetics. Dynamics and productivity of mutual positioning in hybrid forums Proefschrift Universiteit Twente.
- Merkx, Femke, Peter van den Besselaar, Anouschka Versleijen (2007) Kustverdediging: Wetenschap, Beleid en Maatschappelijke vraag Den Haag, Rathenau Instituut. SciSA rapport 0704.